TcoF overview
TcoF: Kdm3a
GeneID: 104263
Name: Lysine-specific demethylase 3A
Ensembl: ENSMUSG00000053470
Species: Mouse
Class: NA
Family: Lysine demethylase
Disease: --
Go-trem: 29
Pathway: 2
Super Enhancer:

chr6:71602124-71602620 chr6:71656039-71656913 chr6:71617750-71618315 chr6:71621559-71622039 chr6:71603264-71603765 chr6:71616665-71617296 chr6:71589691-71590781 chr6:71657787-71662286 chr6:71657718-71659085 chr6:71589908-71591849 chr6:71656259-71656898 chr6:71656235-71658550 chr6:71590250-71591033 chr6:71642543-71650590 chr6:71683251-71684730 chr6:71625989-71626591 chr6:71658138-71662633 chr6:71658262-71662645 chr6:71658042-71658889 chr6:71658062-71662091 chr6:71611735-71612371

Enhancer:

chr6:71222050-71230300 chr6:71364910-71370750 chr6:71379150-71389990 chr6:71444880-71446820 chr6:71446960-71447680 chr6:71494020-71498200 chr6:71502450-71507700 chr6:71557600-71561490 chr6:71563980-71569950 chr6:71570560-71571330 chr6:71571440-71574580 chr6:71574690-71575750 chr6:71582260-71582490 chr6:71582680-71582830 chr6:71857680-71857780 chr6:71575900-71582040 chr6:71222050-71222350 chr6:71389830-71389990 chr6:71494020-71494550 chr6:71875200-71875650 chr6:71912750-71913010 chr6:71913830-71914000 chr6:71931440-71931740 chr6:71444880-71445080 chr6:71494020-71495040 chr6:71494020-71494540 chr6:71444880-71445050 chr6:71657990-71658800 chr6:71690850-71691560 chr6:71494020-71494660 chr6:71494020-71494610 chr6:72339500-72340460 chr6:71388110-71389990 chr6:71444880-71445390 chr6:71494020-71495030 chr6:71581580-71582040 chr6:71104370-71106110 chr6:71222050-71223730 chr6:71249960-71259680 chr6:71262000-71262800 chr6:71282510-71284080 chr6:71284120-71286700 chr6:71287440-71288380 chr6:71294360-71296790 chr6:71300730-71312960 chr6:71323990-71324490 chr6:71324600-71324750 chr6:71324860-71325880 chr6:71348520-71349120 chr6:71389450-71389990 chr6:71494020-71494820 chr6:71706430-71709570 chr6:71709770-71710510 chr6:71716710-71718350 chr6:71718660-71721260 chr6:71727110-71730710 chr6:71444880-71445840 chr6:71494020-71494870 chr6:71580890-71582040 chr6:71287440-71288350 chr6:71294480-71297160 chr6:71305560-71311850 chr6:71325910-71326850 chr6:71329160-71334250 chr6:71336620-71338440 chr6:71444880-71445330 chr6:71494020-71495250 chr6:71344770-71346840 chr6:71346940-71348350 chr6:71386260-71389990 chr6:71446960-71449830 chr6:71494020-71495670 chr6:71657990-71659600 chr6:71671740-71674950 chr6:71581240-71582040 chr6:71389020-71389990 chr6:71494020-71495330 chr6:71657990-71659750 chr6:71687940-71691700 chr6:71581200-71582040 chr6:71222050-71226590 chr6:71229210-71229880 chr6:71389120-71389990 chr6:71672640-71674970 chr6:71706430-71707820 chr6:71738080-71738940 chr6:71769660-71770710 chr6:71580500-71582040 chr6:71388020-71389570 chr6:71911820-71912630 chr6:71494020-71494640 chr6:71657990-71658780 chr6:71494020-71495800 chr6:71684650-71689280 chr6:71879780-71881580 chr6:71911600-71913660 chr6:71913830-71914650 chr6:71918010-71920470 chr6:71929350-71935240 chr6:71579540-71582040 chr6:71494020-71494810 chr6:71557600-71560290 chr6:71657990-71659330 chr6:71706590-71707850 chr6:71729890-71730450 chr6:71581750-71582040 chr6:71494020-71495060 chr6:71222050-71224400 chr6:71242280-71245340 chr6:71389000-71389990 chr6:71494020-71495210 chr6:71657990-71659590 chr6:71222050-71223080 chr6:71389570-71389990 chr6:71444880-71445190 chr6:71581610-71582040 chr6:71494020-71494740 chr6:71494020-71494960 chr6:71494020-71494770 chr6:71387870-71389990 chr6:71494020-71495920 chr6:71608240-71613910 chr6:71666440-71675460 chr6:71579380-71582040 chr6:71208220-71211400 chr6:71222050-71224100 chr6:71389050-71389990 chr6:71494020-71495590 chr6:71608260-71609940 chr6:71610060-71613420 chr6:71666690-71670420 chr6:71580630-71582040 chr6:71222050-71222300 chr6:71494020-71494520 chr6:71707070-71707930 chr6:71875220-71875660 chr6:71706430-71708410 chr6:71580490-71582040 chr6:71389520-71389990 chr6:71494020-71494750 chr6:71581590-71582040 chr6:71161610-71163930 chr6:71176420-71178360 chr6:71185090-71185330 chr6:71198920-71200340 chr6:71208660-71210620 chr6:71210680-71212060 chr6:71222050-71224950 chr6:71243380-71244150 chr6:71389150-71389990 chr6:71444880-71445620 chr6:71494020-71494840 chr6:71505300-71506000 chr6:71566910-71567290 chr6:71571440-71572530 chr6:71899510-71900570 chr6:71900650-71900750 chr6:71929350-71931360 chr6:71937470-71938890 chr6:71581350-71582040 chr6:71389730-71389990 chr6:71494020-71494670 chr6:71389590-71389990 chr6:71444880-71445130 chr6:71494020-71494700 chr6:71657990-71658820 chr6:71581880-71582040 chr6:71389900-71389990 chr6:71494020-71494680 chr6:71494020-71495960 chr6:71370510-71371410 chr6:71371790-71372730 chr6:71389510-71389990 chr6:71425380-71426060 chr6:71444880-71445070 chr6:71539940-71540430 chr6:71769740-71770400 chr6:71899510-71900290 chr6:71581760-71582040 chr6:71386000-71389990 chr6:71494020-71496800 chr6:71564600-71569950 chr6:71580600-71582040 chr6:71494020-71494720 chr6:71577400-71582040 chr6:71176410-71177480 chr6:71222050-71223020 chr6:71389620-71389990 chr6:71657990-71658890 chr6:71707060-71707800 chr6:71388990-71389990 chr6:71494020-71495120 chr6:71690850-71691360 chr6:71444880-71445100 chr6:71558880-71561340 chr6:71611300-71612580 chr6:72047980-72050220 chr6:71494020-71495220 chr6:71608320-71609670 chr6:71580280-71582040 chr6:71368980-71369500 chr6:71571440-71572300 chr6:71581280-71582040 chr6:71389580-71389990 chr6:71707090-71707480 chr6:71880100-71881370 chr6:71581820-71582040 chr6:71385890-71389990 chr6:71444880-71445900 chr6:71494020-71496040 chr6:71690060-71693720 chr6:71706430-71708360 chr6:71935620-71946940 chr6:71577760-71582040 chr6:71422120-71424100 chr6:71428240-71429270 chr6:71429500-71430750 chr6:71494020-71495110 chr6:71505420-71506020 chr6:71608260-71608920 chr6:71611020-71612860 chr6:71668240-71668940 chr6:71581040-71582040 chr6:71389430-71389990 chr6:71494020-71494860 chr6:71581790-71582040 chr6:71389390-71389990 chr6:71444880-71445510 chr6:71494020-71495100 chr6:71657990-71660020 chr6:71580400-71582040 chr6:71693700-71698160 chr6:71368320-71370930 chr6:71911860-71913660 chr6:71929350-71932420 chr6:71176620-71177890 chr6:71222050-71223220 chr6:71389470-71389990 chr6:71494020-71494990 chr6:71657990-71658680 chr6:71688440-71689120 chr6:71706890-71707940 chr6:71940030-71942640 chr6:71430300-71430750 chr6:71571610-71571870 chr6:71608230-71608740 chr6:71883930-71884630 chr6:71879780-71881220 chr6:71685100-71687430 chr6:71706430-71711350 chr6:71388000-71388520 chr6:71494020-71495050 chr6:71505250-71506010 chr6:71900910-71901900 chr6:71913530-71913660 chr6:71913830-71914230 chr6:71929350-71933000 chr6:71581460-71582040 chr6:71685460-71686430 chr6:71706430-71708450 chr6:71737590-71739060 chr6:71332370-71335270 chr6:71388980-71389990 chr6:71429520-71432250 chr6:71448120-71455530 chr6:71494020-71496830 chr6:71565030-71569950 chr6:71571440-71573300 chr6:71938730-71942880 chr6:71576470-71582040 chr6:71444880-71444970 chr6:71939570-71942680 chr6:71389030-71389990 chr6:71446960-71447040 chr6:71494020-71496000 chr6:71581620-71582040 chr6:71494020-71494900 chr6:71581850-71582040 chr6:71494020-71494710 chr6:71222050-71225120 chr6:71444880-71445420 chr6:71494020-71494800 chr6:71593950-71596200 chr6:71938470-71939420 chr6:71579240-71582040 chr6:71387830-71389990 chr6:71494020-71495940 chr6:71580050-71582040 chr6:71668240-71668810 chr6:71256710-71258780 chr6:71284120-71286220 chr6:71294570-71296650 chr6:71309710-71311860 chr6:71333510-71333860 chr6:71346530-71346840 chr6:71346940-71347530 chr6:71514400-71515110 chr6:71582260-71582370 chr6:71672270-71673930 chr6:71688280-71690390 chr6:71716950-71718240 chr6:71719870-71720310 chr6:71737670-71738940 chr6:71581660-71582040 chr6:71728620-71730120 chr6:71389600-71389990 chr6:71494020-71494580 chr6:71930810-71931990 chr6:71581540-71582040 chr6:71494020-71494480 chr6:71558770-71559520 chr6:71494020-71494730 chr6:71571580-71572430 chr6:71581390-71582040 chr6:71389860-71389990 chr6:71494020-71494630 chr6:71558830-71559540 chr6:71657990-71658490

Promoter:

chr6:71630905-71634905

 ChIP-seq based regulatory details of Kdm3a
Sample ID Experiment target Biosample term name Cell type Tissue type Source
TcoF_01_21699 Kdm3a None Adipocyte None Cistrome
TcoF_01_21698 Kdm3a None Adipocyte None Cistrome
 Downstream target genes of Kdm3a
 Upstream regulatory details of Kdm3a
 Protein-protein interaction of Kdm3a
OFFICIAL_SYMBOL_A OFFICIAL_SYMBOL_B EXPERIMENTAL_SYSTEM PUBMED_ID ORGANISM_A_ID ORGANISM_B_ID SOURCE
Kdm3a Ccdc158 Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
Kdm3a Dcaf6 Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
Kdm3a Mycbp2 Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
Kdm3a Phc2 Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
Kdm3a Trank1 Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
 Annotation of Kdm3a
 Disease information of Kdm3a