TcoF overview
TcoF: Smarcd3
GeneID: 66993
Name: SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3
Ensembl: ENSMUSG00000028949
Species: Mouse
Class: NA
Family: SWI/SNF
Disease: --
Go-trem: 27
Pathway: 5
Super Enhancer:

chr5:24596619-24605189 chr5:24596229-24597537 chr5:24595981-24598810 chr5:24595602-24598750 chr5:24595555-24624787 chr5:24612813-24613841 chr5:24595429-24599798 chr5:24598155-24610152 chr5:24595745-24599028 chr5:24604397-24605296 chr5:24598103-24599205 chr5:24595152-24599666 chr5:24595508-24606923 chr5:24595415-24625288 chr5:24596427-24597666 chr5:24596269-24605139 chr5:24619474-24621154 chr5:24611017-24612748 chr5:24598299-24605317

Enhancer:

chr5:23872680-23873010 chr5:23873160-23873290 chr5:23873460-23874320 chr5:23909420-23911630 chr5:23911660-23911930 chr5:23928700-23929260 chr5:23931250-23933330 chr5:23946760-23946850 chr5:23947070-23947150 chr5:23947260-23947340 chr5:23947480-23947540 chr5:23947640-23947740 chr5:23947900-23947990 chr5:23948210-23948820 chr5:23948960-23949090 chr5:23950120-23950880 chr5:24082540-24083160 chr5:24095470-24096120 chr5:24096300-24096880 chr5:24101890-24102620 chr5:24216190-24218080 chr5:24228590-24234100 chr5:24257000-24259180 chr5:24324100-24348000 chr5:24358550-24362460 chr5:24375520-24376870 chr5:24376910-24377310 chr5:24390570-24394890 chr5:23870810-23872570 chr5:23952770-23953570 chr5:24395000-24396220 chr5:24377470-24379700 chr5:23779950-23780260 chr5:23871410-23871640 chr5:24347620-24348000 chr5:24477920-24479980 chr5:23873460-23874070 chr5:23888460-23889070 chr5:23890880-23891040 chr5:23891380-23891570 chr5:23922500-23922640 chr5:23949520-23949710 chr5:23958350-23960640 chr5:24094110-24094910 chr5:24257000-24258590 chr5:24326360-24328420 chr5:24477120-24481600 chr5:24345760-24348000 chr5:23953280-23953570 chr5:23629670-23630560 chr5:23825970-23826570 chr5:23834530-23834980 chr5:23835400-23835930 chr5:23853890-23854120 chr5:23950510-23950880 chr5:23958860-23959810 chr5:24000810-24001170 chr5:24002720-24003100 chr5:24003360-24003880 chr5:24056760-24057490 chr5:24107290-24107590 chr5:24129500-24130390 chr5:24256220-24256470 chr5:24414320-24414610 chr5:24490850-24492330 chr5:24564760-24565660 chr5:23950600-23950880 chr5:24083020-24083160 chr5:24082680-24083160 chr5:24107080-24107590 chr5:23892940-23893200 chr5:23958350-23959890 chr5:24410300-24410460 chr5:23847760-23854120 chr5:23854350-23857020 chr5:24330660-24334320 chr5:24345880-24348000 chr5:23848580-23851370 chr5:23894260-23895590 chr5:23958350-23960120 chr5:24102040-24102620 chr5:24329250-24331450 chr5:24420900-24421380 chr5:24345830-24348000 chr5:23832590-23834980 chr5:23835400-23836720 chr5:23853000-23854120 chr5:23920760-23921200 chr5:23921350-23921620 chr5:23922500-23922770 chr5:23922860-23922940 chr5:23923020-23923110 chr5:23923180-23923310 chr5:23927940-23928140 chr5:23928200-23928310 chr5:23928370-23928460 chr5:23928530-23928610 chr5:23933450-23935230 chr5:23935390-23935520 chr5:23958350-23963190 chr5:23978620-23982190 chr5:23982250-23982450 chr5:23982530-23982720 chr5:23989000-23989150 chr5:23993710-23995330 chr5:24030090-24031920 chr5:24081890-24082330 chr5:24101300-24101540 chr5:24101660-24101760 chr5:24106080-24107590 chr5:24117820-24119560 chr5:24126820-24131670 chr5:24257000-24258410 chr5:24382850-24383100 chr5:23888040-23888340 chr5:23852580-23854120 chr5:23883800-23885520 chr5:23885650-23885760 chr5:23885840-23885990 chr5:23886170-23886680 chr5:23886860-23887180 chr5:23887390-23887470 chr5:23891180-23891260 chr5:23892360-23892760 chr5:23893360-23893500 chr5:23894260-23894780 chr5:23958350-23962940 chr5:23978400-23982190 chr5:23993710-23995300 chr5:24056620-24057770 chr5:24081700-24082330 chr5:24117820-24119600 chr5:24123350-24132500 chr5:24218560-24218660 chr5:24218770-24221340 chr5:24257000-24258580 chr5:24379820-24380970 chr5:24381030-24382800 chr5:24382850-24382920 chr5:24409100-24410170 chr5:24410530-24411930 chr5:24412340-24412520 chr5:24465510-24470740 chr5:23888230-23888340 chr5:24100810-24100960 chr5:24346150-24348000 chr5:24412100-24412250 chr5:24101890-24102540 chr5:24129500-24130360 chr5:24319680-24323570 chr5:24324010-24337470 chr5:24341930-24348000 chr5:23825960-23827060 chr5:23828030-23828470 chr5:24254620-24256420 chr5:24257000-24259950 chr5:23953100-23953570 chr5:23953290-23953570 chr5:23958350-23959910 chr5:24082220-24082330 chr5:24094660-24094910 chr5:24257000-24259030 chr5:23952770-23952990 chr5:24347120-24348000 chr5:24129940-24130850 chr5:23835400-23836120 chr5:23933450-23933610 chr5:23958350-23959950 chr5:24027170-24031920 chr5:24257000-24258460 chr5:24000250-24002070 chr5:24107100-24107590 chr5:24235780-24235990 chr5:24082720-24083160 chr5:23846930-23854120 chr5:23891660-23891820 chr5:23891950-23892120 chr5:23895740-23896270 chr5:23896440-23896830 chr5:23949270-23949710 chr5:24081680-24082330 chr5:24229390-24234520 chr5:23888140-23888340 chr5:24081500-24082330 chr5:23832680-23833070 chr5:23928760-23929260 chr5:24332290-24333310 chr5:24347650-24348000 chr5:24106040-24107590 chr5:24235840-24235990 chr5:23958350-23962600 chr5:24081780-24082330 chr5:24096770-24096880 chr5:24106000-24107590 chr5:23830970-23831310 chr5:23846910-23848610 chr5:23853040-23854120 chr5:23894940-23895590 chr5:23931250-23933170 chr5:23958350-23962700 chr5:23979750-23981260 chr5:24041520-24041960 chr5:24044280-24045420 chr5:24045690-24045850 chr5:24046270-24046470 chr5:24106390-24107590 chr5:24331210-24331490 chr5:23979710-23980270 chr5:24347490-24348000 chr5:23825960-23827040 chr5:23827240-23827450 chr5:23828570-23828880 chr5:23829080-23829330 chr5:23833960-23834980 chr5:23842900-23844070 chr5:23847720-23851940 chr5:23853950-23854120 chr5:23855990-23857020 chr5:23893140-23893200 chr5:23895220-23895590 chr5:23929120-23929260 chr5:23932040-23932870 chr5:23933860-23934710 chr5:23958350-23960510 chr5:23978500-23979280 chr5:23979780-23981120 chr5:24002720-24002980 chr5:24030580-24031570 chr5:24056620-24057560 chr5:24101350-24101540 chr5:24106370-24107590 chr5:23953200-23953570 chr5:23854350-23854940 chr5:23953250-23953570 chr5:23853030-23854120 chr5:23894260-23894460 chr5:23958350-23960360 chr5:24007860-24010240 chr5:24082150-24082330 chr5:24096320-24096880 chr5:24106730-24107590 chr5:24125550-24127270 chr5:24129490-24131060 chr5:23953020-23953570 chr5:23937480-23938570 chr5:23958350-23959600 chr5:23979000-23982190 chr5:24303530-24305240 chr5:24307000-24308640 chr5:24325800-24334400 chr5:24435600-24440000 chr5:24468400-24471000 chr5:24478600-24480260 chr5:23854350-23855600 chr5:23958350-23963400 chr5:24081200-24082330 chr5:23536130-23536290 chr5:23834210-23834980 chr5:23835400-23836330 chr5:23853230-23854120 chr5:23888890-23889070 chr5:23894980-23895590 chr5:23933450-23934990 chr5:23958540-23959990 chr5:23978340-23981900 chr5:23994450-23997340 chr5:24056620-24057720 chr5:24059470-24060240 chr5:24102000-24102620 chr5:24106050-24107590 chr5:24129310-24130850 chr5:24235090-24235990 chr5:24246840-24248170 chr5:24257000-24258560 chr5:24346620-24348000 chr5:23854350-23854930 chr5:23833910-23834980 chr5:23835400-23836010 chr5:23893020-23893200 chr5:23933450-23934730 chr5:23958350-23961080 chr5:23978260-23979660 chr5:23979820-23981290 chr5:24082760-24083160 chr5:24102350-24102620 chr5:24106140-24107590 chr5:24125240-24127170 chr5:24130110-24130610 chr5:24235050-24235990 chr5:24246980-24248300 chr5:24257000-24258510 chr5:24414320-24414940 chr5:23953450-23953570 chr5:24346730-24348000 chr5:24095470-24095750 chr5:23843020-23844220 chr5:23848600-23851480 chr5:23853060-23854120 chr5:23888780-23889070 chr5:23933450-23934380 chr5:23958350-23960040 chr5:24056620-24057590 chr5:24082620-24083160 chr5:24106200-24107590 chr5:23953030-23953570 chr5:23950270-23950880 chr5:23958350-23958490 chr5:23981350-23982020 chr5:24082880-24083160 chr5:24331660-24332740 chr5:23854350-23855160 chr5:23832800-23834260 chr5:23835400-23835650 chr5:23843110-23844170 chr5:23853760-23854120 chr5:23856840-23857020 chr5:23894260-23894680 chr5:23933860-23934360 chr5:23958620-23959970 chr5:23978380-23981910 chr5:24106780-24107590 chr5:24229120-24232270 chr5:24232840-24233360 chr5:24235930-24235990 chr5:24327290-24327590 chr5:24331600-24333060 chr5:23953000-23953570 chr5:24345730-24348000 chr5:23854350-23854690 chr5:23832590-23833460 chr5:23855580-23857020 chr5:23933450-23935180 chr5:23958350-23962550 chr5:24017490-24019580 chr5:24376360-24376870 chr5:24478670-24480800 chr5:24360610-24361850 chr5:23847960-23854120 chr5:23856570-23857020 chr5:23883810-23885520 chr5:23910020-23911630 chr5:24010950-24012200 chr5:24018080-24018500 chr5:24081440-24082330 chr5:24140040-24141270 chr5:24360470-24361860 chr5:24375120-24376870 chr5:24432690-24434670 chr5:24441950-24443110 chr5:23871060-23871900 chr5:23887550-23888340 chr5:24164930-24166830 chr5:24346100-24348000 chr5:23854350-23854990 chr5:24379010-24379580 chr5:24106920-24107590 chr5:24128020-24131060 chr5:24105980-24107590 chr5:24010950-24011640 chr5:23524370-23528070 chr5:23829080-23829450 chr5:23833240-23834980 chr5:23842330-23844250 chr5:23848550-23851790 chr5:23855890-23857020 chr5:23888770-23889070 chr5:23922500-23922620 chr5:23933450-23934830 chr5:23958350-23959980 chr5:24030440-24031920 chr5:24106500-24107590 chr5:24322360-24323570 chr5:24330990-24333100 chr5:23953110-23953570 chr5:24346060-24348000 chr5:24101330-24101540 chr5:24414320-24414980 chr5:23721160-23721960 chr5:24414640-24414980 chr5:23953300-23953570 chr5:24056800-24057770 chr5:24347240-24348000 chr5:24327030-24335470 chr5:24343290-24348000 chr5:23928840-23929260 chr5:23950240-23950880 chr5:24257000-24258320 chr5:24332860-24333910 chr5:24346580-24348000 chr5:23931250-23931360 chr5:23931570-23933330 chr5:24474970-24480660 chr5:23853080-23854120 chr5:23854350-23856930 chr5:23933450-23933780 chr5:23948680-23948820 chr5:24081580-24082330 chr5:24124810-24127720 chr5:24257000-24258610 chr5:24477870-24480210 chr5:24339980-24348000 chr5:23958350-23959350 chr5:24060600-24061180 chr5:24082660-24083160 chr5:23953260-23953570 chr5:23835400-23836180 chr5:23853480-23854120 chr5:23879950-23880350 chr5:23888810-23889070 chr5:23933890-23934690 chr5:23958630-23960940 chr5:23979060-23982190 chr5:24046340-24046470 chr5:24106980-24107590 chr5:24235240-24235990 chr5:24326240-24328070 chr5:24479180-24480250 chr5:24346560-24348000 chr5:23854350-23855300 chr5:23950250-23950880 chr5:24082800-24083160 chr5:24102210-24102620 chr5:24129360-24130590 chr5:24414320-24414830 chr5:23953160-23953570 chr5:24346880-24348000 chr5:24060980-24061180 chr5:24082070-24082330 chr5:23909900-23911630 chr5:23948760-23948820 chr5:24009450-24010240 chr5:24081630-24082330 chr5:23854350-23855660 chr5:23953220-23953570 chr5:24081740-24082330 chr5:24229980-24231470 chr5:23854350-23856990 chr5:23854000-23854120 chr5:23950420-23950880 chr5:23953270-23953570 chr5:24347480-24348000 chr5:23928800-23929260 chr5:24082740-24083160 chr5:24101440-24101540 chr5:24106810-24107590 chr5:24129900-24131070 chr5:24257000-24258720 chr5:24330980-24332180 chr5:24572860-24573620 chr5:24346190-24348000 chr5:23888640-23889070 chr5:23950400-23950880 chr5:24017820-24019150 chr5:24082670-24083160 chr5:24257000-24258840 chr5:23953150-23953570 chr5:24082610-24083160 chr5:23825960-23826300 chr5:23828170-23828470 chr5:23831130-23831310 chr5:23853830-23854120 chr5:23888960-23889070 chr5:23893010-23893200 chr5:23895040-23895590 chr5:23922500-23922590 chr5:23929020-23929260 chr5:23950340-23950880 chr5:23978800-23979280 chr5:23980740-23981210 chr5:24018000-24018520 chr5:24082900-24083160 chr5:24130040-24130390 chr5:24257000-24258380 chr5:23953330-23953570 chr5:24347180-24348000 chr5:23854350-23854770

Promoter:

chr5:24600002-24604002

 ChIP-seq based regulatory details of Smarcd3
Sample ID Experiment target Biosample term name Cell type Tissue type Source
 Downstream target genes of Smarcd3
 Upstream regulatory details of Smarcd3
 Protein-protein interaction of Smarcd3
OFFICIAL_SYMBOL_A OFFICIAL_SYMBOL_B EXPERIMENTAL_SYSTEM PUBMED_ID ORGANISM_A_ID ORGANISM_B_ID SOURCE
 Annotation of Smarcd3
 Disease information of Smarcd3