TcoF overview
TcoF: Usp7
GeneID: 252870
Name: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7
Ensembl: ENSMUSG00000022710
Species: Mouse
Class: class 2
Family: Others
Disease: --
Go-trem: 34
Pathway: 18
Super Enhancer:

chr16:8734808-8785572 chr16:8765763-8769348 chr16:8735092-8735715 chr16:8714701-8735322 chr16:8762244-8769354 chr16:8707643-8708295 chr16:8691972-8709911 chr16:8706644-8709886 chr16:8724015-8725143 chr16:8702933-8703541 chr16:8745706-8769380 chr16:8746562-8753115 chr16:8768551-8781119 chr16:8762504-8763830 chr16:8706816-8707630 chr16:8765898-8766851 chr16:8745549-8748718 chr16:8722832-8725051 chr16:8768198-8769416 chr16:8764639-8792643 chr16:8719200-8721960 chr16:8743566-8750229 chr16:8715184-8734154 chr16:8748031-8795324 chr16:8728072-8728447 chr16:8746232-8769683 chr16:8746260-8769611 chr16:8743850-8752895

Enhancer:

chr16:8539390-8542050 chr16:8636480-8637570 chr16:8655780-8656640 chr16:8657610-8658670 chr16:8661190-8663670 chr16:8664510-8672200 chr16:8716710-8738290 chr16:8788120-8791980 chr16:8831490-8843060 chr16:8843330-8855880 chr16:8859010-8868680 chr16:8714120-8716600 chr16:8830770-8831410 chr16:8766380-8766610 chr16:8784900-8785170 chr16:8830770-8831270 chr16:8470950-8471510 chr16:8636610-8637570 chr16:8662490-8663670 chr16:8663800-8664340 chr16:8831490-8833030 chr16:8861140-8867320 chr16:8715700-8716230 chr16:8649680-8651120 chr16:8612320-8612940 chr16:8636930-8637570 chr16:8831490-8831550 chr16:8470950-8471300 chr16:8523890-8524590 chr16:8566320-8567260 chr16:8636950-8637570 chr16:8830770-8831370 chr16:8831490-8831630 chr16:8734940-8738290 chr16:8831490-8832410 chr16:8470950-8471910 chr16:8610070-8611210 chr16:8737020-8738290 chr16:8830770-8831330 chr16:8831490-8832260 chr16:8736830-8738290 chr16:8831490-8832350 chr16:8410830-8412190 chr16:8470950-8472420 chr16:8513660-8516150 chr16:8539360-8542060 chr16:8690970-8691230 chr16:8691320-8691440 chr16:8691510-8691640 chr16:8691760-8692470 chr16:8692570-8692850 chr16:8735400-8738290 chr16:8831490-8832770 chr16:8860800-8866230 chr16:8937500-8940470 chr16:8420220-8422280 chr16:8513660-8516560 chr16:8523140-8524830 chr16:8538450-8542720 chr16:8692570-8693110 chr16:8693210-8693450 chr16:8734670-8738290 chr16:8831490-8832450 chr16:8861250-8865770 chr16:8937390-8940560 chr16:8667120-8672200 chr16:8664510-8668700 chr16:8717140-8721330 chr16:8726030-8727320 chr16:8831490-8832400 chr16:9132160-9133290 chr16:8470950-8471450 chr16:8636960-8637570 chr16:8765990-8766840 chr16:8784440-8785180 chr16:8831490-8832080 chr16:8513660-8513820 chr16:8732710-8738290 chr16:8831490-8838870 chr16:8861170-8865370 chr16:8665210-8672200 chr16:8532390-8535060 chr16:8656380-8656640 chr16:8736090-8738290 chr16:8772660-8781770 chr16:8782010-8784840 chr16:8786700-8793130 chr16:9131800-9134090 chr16:8667250-8672200 chr16:8748430-8751090 chr16:8611380-8614070 chr16:8733150-8738170 chr16:8751220-8753340 chr16:8831490-8832270 chr16:8667040-8670240 chr16:8748430-8748810 chr16:8533230-8533850 chr16:8554500-8555200 chr16:8555250-8555830 chr16:8772940-8775030 chr16:8778960-8779390 chr16:8788100-8789540 chr16:8470950-8472710 chr16:8513660-8513960 chr16:8532480-8535790 chr16:8552580-8556640 chr16:8718370-8732510 chr16:8732720-8738290 chr16:8831490-8841100 chr16:8665500-8672200 chr16:8748430-8749380 chr16:8863220-8865180 chr16:8513660-8514290 chr16:8655160-8655640 chr16:8657610-8657800 chr16:8778420-8779500 chr16:8831490-8831860 chr16:8748430-8749080 chr16:8565780-8566780 chr16:8523350-8524710 chr16:8737630-8738290 chr16:8470950-8473920 chr16:8529200-8532260 chr16:8614220-8614840 chr16:8732740-8738290 chr16:8750330-8753780 chr16:8831490-8833050 chr16:8748430-8749760 chr16:8751580-8752780 chr16:8831490-8832520 chr16:8871400-8873760 chr16:9080300-9087320 chr16:8666250-8672200 chr16:8748430-8748940 chr16:8784060-8785590 chr16:8667200-8667820 chr16:8734250-8738290 chr16:8831490-8832340 chr16:8665510-8672200 chr16:8513660-8515960 chr16:8831490-8832250 chr16:8666070-8672200 chr16:8831490-8832320 chr16:8665800-8672200 chr16:8661930-8663670 chr16:8737680-8738290 chr16:8831490-8832100 chr16:8843330-8845180 chr16:8861180-8865730 chr16:8715380-8716430 chr16:8514080-8514880 chr16:8523910-8524470 chr16:8565690-8567020 chr16:8737530-8738290 chr16:8831490-8831740 chr16:8831490-8831600 chr16:8551070-8556750 chr16:8559880-8567820 chr16:8652700-8655640 chr16:8693210-8693790 chr16:8700290-8702050 chr16:8843330-8846540 chr16:8712280-8716600 chr16:8513660-8516020 chr16:8523060-8525310 chr16:8700400-8701200 chr16:8737450-8738290 chr16:8843740-8844370 chr16:8513660-8519400 chr16:8519800-8528400 chr16:8563000-8572920 chr16:8599200-8600400 chr16:8605750-8608000 chr16:8664600-8672200 chr16:8728100-8738290 chr16:8831490-8832800 chr16:8860200-8865800 chr16:8601080-8602370 chr16:8830770-8831300 chr16:8470950-8471840 chr16:8522600-8525360 chr16:8538980-8539900 chr16:8737610-8738290 chr16:8831490-8832040 chr16:8446560-8448070 chr16:8470950-8472100 chr16:8513660-8513800 chr16:8522660-8525500 chr16:8636920-8637570 chr16:8737730-8738290 chr16:8470950-8472220 chr16:8609810-8611210 chr16:8614220-8615640 chr16:8693210-8693610 chr16:8728180-8738290 chr16:8750070-8753840 chr16:8748430-8750030 chr16:8470950-8471820 chr16:8514180-8514620 chr16:8523310-8525090 chr16:8540990-8541500 chr16:8734270-8738290 chr16:8784580-8785170 chr16:8834130-8834810 chr16:8862230-8863050 chr16:8664510-8668950 chr16:8863600-8864590 chr16:8523270-8524570 chr16:8664510-8668930 chr16:8737660-8738290 chr16:8784740-8785140 chr16:8863540-8864720 chr16:8539580-8542390 chr16:8737670-8738290 chr16:8843330-8855590 chr16:8860180-8865720 chr16:8748430-8749200 chr16:9089920-9095080 chr16:8612330-8614040 chr16:8454830-8456110 chr16:8470950-8471790 chr16:8490290-8493640 chr16:8525770-8526880 chr16:8529410-8531570 chr16:8611960-8614070 chr16:8725650-8727020 chr16:8734260-8738290 chr16:8751670-8752880 chr16:8778650-8781690 chr16:8859010-8865780 chr16:8748430-8749690 chr16:8764220-8765480 chr16:8831490-8831620 chr16:8736780-8738290 chr16:8831490-8831970 chr16:8861580-8865780 chr16:8937130-8940420 chr16:8861980-8863030 chr16:8470950-8472090 chr16:8488510-8488750 chr16:8488920-8490190 chr16:8513660-8515060 chr16:8523030-8524960 chr16:8538950-8541960 chr16:8565280-8567490 chr16:8691760-8692290 chr16:8737340-8738290 chr16:8778630-8779290 chr16:8871880-8872380 chr16:8936200-8937130 chr16:8830770-8831360 chr16:8539300-8541600 chr16:8830770-8831380 chr16:8765980-8766730 chr16:8861660-8863360 chr16:8666060-8668740 chr16:8831490-8831830 chr16:8663140-8663670 chr16:8784500-8785490 chr16:8831490-8838860 chr16:8861250-8865610 chr16:8513660-8513900 chr16:8737770-8738290 chr16:8831490-8831800 chr16:8863880-8864670 chr16:8661310-8663670 chr16:8664510-8666980 chr16:8718330-8721080 chr16:8770420-8772500 chr16:8831490-8832210 chr16:8831490-8831900 chr16:8736850-8738290 chr16:8831490-8831640 chr16:8861890-8863290 chr16:8665270-8668360 chr16:8863520-8864680 chr16:8513660-8513950 chr16:8637090-8637570 chr16:8470950-8471560 chr16:8636720-8637570 chr16:8718420-8722520 chr16:8769930-8771660 chr16:8783330-8784140 chr16:8665300-8667930 chr16:8682240-8683680 chr16:8831490-8833130 chr16:8861220-8863000 chr16:8666160-8670100 chr16:8655780-8656210 chr16:8861560-8862940 chr16:8748430-8748770 chr16:8578910-8579950 chr16:8610400-8611210 chr16:8719420-8719830 chr16:8737290-8738290 chr16:8831490-8831980 chr16:8748430-8748750 chr16:8737760-8738290 chr16:8831490-8831750 chr16:8656370-8656640 chr16:8772660-8774400 chr16:8778640-8779500 chr16:8788180-8789420 chr16:8666320-8671200 chr16:8748430-8748920 chr16:8636910-8637570 chr16:8654120-8655640 chr16:8859010-8865210 chr16:8666220-8668580 chr16:8649780-8650730 chr16:8532520-8533870 chr16:8555420-8556070 chr16:8637030-8637570 chr16:8770510-8771460 chr16:8778420-8779220 chr16:8782580-8784050 chr16:8831490-8831950 chr16:8936520-8936970 chr16:9132730-9134040 chr16:8748430-8748620

Promoter:

chr16:8736342-8740342

 ChIP-seq based regulatory details of Usp7
Sample ID Experiment target Biosample term name Cell type Tissue type Source
TcoF_01_20533 Usp7 None Embryonic Stem Cell None Cistrome
TcoF_01_20532 Usp7 None Embryonic Stem Cell None Cistrome
 Downstream target genes of Usp7
 Upstream regulatory details of Usp7
 Protein-protein interaction of Usp7
OFFICIAL_SYMBOL_A OFFICIAL_SYMBOL_B EXPERIMENTAL_SYSTEM PUBMED_ID ORGANISM_A_ID ORGANISM_B_ID SOURCE
Usp7 Mdm2 Affinity Capture-Western 20697359 10090 10090 BIOGRID
Usp7 Mdm4 Affinity Capture-Western 20697359 10090 10090 BIOGRID
Usp7 Irs1 Affinity Capture-Western 27568561 10090 10090 BIOGRID
Usp7 Pten Affinity Capture-Western 27568561 10090 10090 BIOGRID
Usp7 Ppp6c Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
Usp7 Ppp6r3 Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
Usp7 Mark4 Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
Usp7 Vps29 Co-fractionation 32325033 10090 10090 BIOGRID
 Annotation of Usp7
 Disease information of Usp7